Каковы правильные разрешения для папки загрузки с PHP/Apache?

Я бы согласился с ответом php-include Райана, если вы действительно php-namespaces хотите это сделать.

Как правило, в php-frameworks среде *nix вы всегда должны php-include давать как можно меньше разрешений.

В php-cli 9 случаях из 10 755 — идеальное php-cli разрешение для этого, поскольку php-cli единственным пользователем, имеющим php возможность изменять файлы, будет upload веб-сервер. Измените это php.ini на 775 с вашим ftp-пользователем apache в группе, если вам ДЕЙСТВИТЕЛЬНО php-namespaces нужно это изменить.

Поскольку php-include вы, по собственному признанию, новичок php в php, вот полезная ссылка php-include для повышения безопасности php-namespaces вашего сервиса загрузки: move_uploaded_file