Добавление функций сценариев в приложения .NET

Возможно, вы сможете использовать dotnet для этого IronRuby.

В противном .net случае я бы посоветовал вам compiler иметь каталог, в который scripts вы будете помещать предварительно compiler скомпилированные сборки. Затем c-sharp вы можете иметь ссылку в compiler БД на сборку и класс и использовать dotnet отражение для загрузки правильных compiler сборок во время выполнения.

Если c#-language вы действительно хотите компилировать c# во время выполнения, вы можете csharp использовать CodeDOM, а затем scripts использовать отражение для dotnet загрузки динамической сборки. Microsoft documentation article which might help.